DNA BARCODING VATICA VENULOSA KOLEKSI KEBUN RAYA BOGOR

Yohana Dwi Erica Kaus Putri (2022) DNA BARCODING VATICA VENULOSA KOLEKSI KEBUN RAYA BOGOR. Final Year Projects (S1) thesis, Universitas Kristen Duta Wacana.

	Text (Skripsi Biologi) 31180209_bab1_bab5_daftarpustaka.pdf Download (1MB)
	Text (Skripsi Biologi) 31180209_bab2 sd bab4_lampiran.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB) \| Request a copy

Abstract

Vatica venulosa masuk ke dalam spesies Critically Endangered yaitu terancam punah pada habitat aslinya, database sekuen V.venulosa masih sangat terbatas. DNA barcoding merupakan metode efisien untuk karakterisasi urutan DNA melalui penanda molekuler rbcL, psbA-trnH intergenic spacer dan ITS. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan barcoding V.venulosa sehingga hasil barcoding dapat digunakna untuk menambah database. Penelitian ini dilaksanakan pada Oktober 2021-Januari 2022 di Laboratorium Treub, Pusat Konservasi dan Kebun Raya Bogor dan analisis data dilakukan di Laboratorium Komputer Universitas Kristen Duta Wacana Yogyakarta Indonesia. Sampel yang digunakan yaitu DNA dari V. venulosa koleksi Kebun Raya Bogor Indonesia. Amplifikasi menggunakan primer rbcL, psbA-trnH intergenic spacer dan ITS, kemudian dilakukan sekuensing. Editing sekuen mengunakan MEGA X kemudian identifikasi BLAST di NCBI, Multiple Sequence Alignment dan konstruksi pohon filogeni menggunakan MEGA X dengan metode UPGMA dan parameter Kimura�2. Diperoleh sekuens yang dapat menambah database Vatica venulosa berdasarkan sekuen rbcL, psbA-trnH, dan ITS. Hasil analisis pohon filogenetik, sekuen rekomendasi menjadi barcode V. venulosa adalah sekuen ITS, sekuen ini dapat mendeterminasi sampai pada spesies, serta dapat memisahkan antar genus. Hasil berupa sekuen DNA Vatica venulosa berdasarkan sekuen rbcL, psbA-trnH, dan multilokus rbcL+ITS, rbcL+psbA-trnH intergenic spacer dan psbA-trnH intergenic spacer +ITS, hasil konstruksi pohon filogeni menjadi referensi baru dan pengembangan baru dalam identifikasi Vatica venulosa, serta dapat digunakan untuk pengembangan penelitian selanjutnya.

Item Type:	Student paper (Final Year Projects (S1))
Uncontrolled Keywords:	Dipterocarpaceae, DNA barcoding, tumbuhan terancam kepunahan, Vatica venulosa
Subjects:	G Geografi. Antropologi. Rekreasi > Rekreasi dan Hiburan Q Ilmu Pengetahuan > Sejarah Alam > Biologi Q Ilmu Pengetahuan > Botani / Ilmu Tumbuhan
Divisions:	Fakultas Bioteknologi > Prodi Biologi
Depositing User:	Jessica Dipta Novyana, A.Md
Date Deposited:	01 Sep 2022 04:52
Last Modified:	01 Sep 2022 04:52
URI:	http://katalog.ukdw.ac.id/id/eprint/7020

Actions (login required)

View Item