POTENSI PRIMER BARU UNTUK DETEKSI MOLEKULER Escherichia coli DARI AIR SUMUR DI WILAYAH KLITREN

31110016, RADEN AJENG MERTHA PRANA (2015) POTENSI PRIMER BARU UNTUK DETEKSI MOLEKULER Escherichia coli DARI AIR SUMUR DI WILAYAH KLITREN. Bachelor thesis, Universitas Kristen Duta Wacana.

[img] Text (Skripsi Biologi)
31110016_bab1_bab5_daftarpustaka.pdf

Download (484kB)
[img] Text (Skripsi Biologi)
31110016_bab2-sd-bab4_lampiran.pdf
Restricted to Registered users only

Download (974kB) | Request a copy

Abstract

Escherichia coli dikenal sebagai bakteri indikator untuk keamanan air minum, kehadiran Escherichia coli sebagai tanda bahwa air tidak aman untuk diminum. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan E. coli di sumur daerah Klitren, Yogyakarta yang digunakan sebagai air minum. Sampel air sumur dikumpulkan, dan kemudian diolah pada membran ultra filtrasi. Sampel air sumur kemudian diinokulasi pada media selektif E. coli. Diperoleh 81 isolat biru gelap yang diduga E. coli dari media selektif. Kemudian tes biokimia dilakukan untuk memastikan koloni yang diduga sebagai E. coli termasuk uji motilitas, indol dan fermentasi sorbitol, metil merah, tes lisin dekarboksilase dan pertumbuhan pada laktosa broth. Hasil penelitian menunjukkan 27 koloni memberi hasil positif E. coli. Kemudian konfirmasi dilakukan dengan deteksi molekuler menarget gen gyrB dan lacZ. Pasangan primer spesifik yang berasal dari conserved area meliputi gen yang digunakan untuk in silico dan in vitro dalam studi PCR. Analisis ini menghasilkan pasangan primer baru yang spesifik untuk E. coli. Hasil penelitian menunjukkan adanya E. coli dalam sampel sebelum filtrasi dan tidak ditemukan E. coli pada sampel setelah filtrasi. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa jenis E. coli adalah Enterohemorrhagic (EHEC), Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli (ExPEC), Invasive E. coli (AIEC), dan Shiga Toxin Producing E. coli (STEC).

Item Type: Thesis (Bachelor)
Uncontrolled Keywords: E. coli, sampel air sumur, gen gyrB, gen lacZ, in silico study, PCR
Subjects: Q Science > QH Natural history > QH426 Genetics
Q Science > QR Microbiology
Divisions: Fakultas Bioteknologi > Prodi Biologi
Depositing User: Ms Claresta Erlinda - keluar
Date Deposited: 22 Jun 2020 22:30
Last Modified: 22 Jun 2020 22:30
URI: http://katalog.ukdw.ac.id/id/eprint/2705

Actions (login required)

View Item View Item