eprintid: 7020
rev_number: 10
eprint_status: archive
userid: 40
dir: disk0/00/00/70/20
datestamp: 2022-09-01 04:52:42
lastmod: 2022-09-01 04:52:42
status_changed: 2022-09-01 04:52:42
type: thesis
metadata_visibility: show
contact_email: yohanadwiericakausputri@gmail.com
creators_name: , Yohana Dwi Erica Kaus Putri
creators_id: 31180209
contributors_type: http://www.loc.gov/loc.terms/relators/THS
contributors_type: http://www.loc.gov/loc.terms/relators/THS
contributors_name: Satwika, Dhira
contributors_name: Hariri, Muhammad Rifqi
contributors_id: 0514076601
contributors_id: 199005212018011004
corp_creators: Universitas Kristen Duta Wacana
title: DNA BARCODING VATICA VENULOSA KOLEKSI KEBUN RAYA BOGOR
ispublished: unpub
subjects: GV
subjects: QH301
subjects: QK
divisions: bioteknologi
full_text_status: restricted
keywords: Dipterocarpaceae, DNA barcoding, tumbuhan terancam kepunahan,  Vatica venulosa
abstract: Vatica venulosa masuk ke dalam spesies Critically Endangered yaitu terancam punah pada habitat aslinya, database sekuen V.venulosa masih sangat terbatas. DNA barcoding merupakan metode efisien untuk karakterisasi urutan DNA  melalui penanda molekuler rbcL, psbA-trnH intergenic spacer dan ITS.  Penelitian ini bertujuan untuk melakukan barcoding V.venulosa sehingga hasil  barcoding dapat digunakna untuk menambah database. Penelitian ini  dilaksanakan pada Oktober 2021-Januari 2022 di Laboratorium Treub, Pusat  Konservasi dan Kebun Raya Bogor dan analisis data dilakukan di Laboratorium  Komputer Universitas Kristen Duta Wacana Yogyakarta Indonesia. Sampel yang  digunakan yaitu DNA dari V. venulosa koleksi Kebun Raya Bogor Indonesia.  Amplifikasi menggunakan primer rbcL, psbA-trnH intergenic spacer dan ITS,  kemudian dilakukan sekuensing. Editing sekuen mengunakan MEGA X kemudian identifikasi BLAST di NCBI, Multiple Sequence Alignment dan konstruksi pohon  filogeni menggunakan MEGA X dengan metode UPGMA dan parameter Kimura�2. Diperoleh sekuens yang dapat menambah database Vatica venulosa berdasarkan sekuen rbcL, psbA-trnH, dan ITS. Hasil analisis pohon filogenetik,  sekuen rekomendasi menjadi barcode V. venulosa adalah sekuen ITS, sekuen ini  dapat mendeterminasi sampai pada spesies, serta dapat memisahkan antar genus.  Hasil berupa sekuen DNA Vatica venulosa berdasarkan sekuen rbcL, psbA-trnH,  dan multilokus rbcL+ITS, rbcL+psbA-trnH intergenic spacer dan psbA-trnH intergenic spacer +ITS, hasil konstruksi pohon filogeni menjadi referensi baru  dan pengembangan baru dalam identifikasi Vatica venulosa, serta dapat  digunakan untuk pengembangan penelitian selanjutnya.
date: 2022-08-06
date_type: published
pages: 44
institution: Universitas Kristen Duta Wacana
department: Fakultas Bioteknologi
thesis_type: skripsi
thesis_name: other
citation:   Yohana Dwi Erica Kaus Putri  (2022) DNA BARCODING VATICA VENULOSA KOLEKSI KEBUN RAYA BOGOR.  Final Year Projects (S1) thesis, Universitas Kristen Duta Wacana.   
document_url: https://katalog.ukdw.ac.id/7020/1/31180209_bab1_bab5_daftarpustaka.pdf
document_url: https://katalog.ukdw.ac.id/7020/2/31180209_bab2%20sd%20bab4_lampiran.pdf